Anteriormente, el juego se sentía como una colección de niveles desconectados. La 4.0.0 introduce un sistema de mucho más robusto. Ahora, los creadores no solo diseñan niveles individuales, sino que pueden crear una aventura cohesiva, conectando fases mediante caminos, casas de Toad y castillos. La interfaz de usuario (UI) fue rediseñada para parecerse más a Super Mario Maker 2 de Nintendo Switch, ofreciendo un acceso más rápido a las herramientas.